Singularity Usage

官方文档：https://docs.sylabs.io/guides/3.2/user-guide/cli.html

简介

待施工

拉取外部容器

singularity pull QTLtools.sif docker://naotokubota/qtltools

拉取外部容器后进行更改

待施工

运行容器

类命令行工具的运行容器

singularity exec bind /pmaster/wencjien/sceQTL:/pmaster/wenjichen/sceQTL QTLtools.sif QTLtools pca --vcf 012/chr21.filter.vcf.gz --scale --center --distance 50000 --out pca/chr21.filter

交互式运行容器

singularity shell QTLtools.sif

Rerference

Singularity日常使用